Epidémiologie moléculaire du Blastocystis sp. en Algérie

Abstract

Ce travail s’inscrit dans le cadre d’une étude approfondie sur l’épidémiologie moléculaire de Blastocystis sp. en Algérie, visant à explorer la prévalence et la diversité génétique de ce parasite chez plus de 40 familles d’animaux sauvages et domestiques à travers différentes régions du pays. Une investigation moléculaire, réalisée entre avril 2021 et octobre 2023, a analysé 620 échantillons fécaux d’animaux. Cette étude a permis de clarifier la prévalence moléculaire de Blastocystis sp., d’identifier les facteurs de risque associés à son infection et de mettre en évidence la relation entre ce parasite et la composition du microbiote chez les animaux étudiés. Dix-huit sous-types (ST) de Blastocystis sp. ont été détectés en Algérie. Les animaux domestiques, tels que les chats et les chiens, ont été identifiés comme des réservoirs potentiels de Blastocystis sp., avec une prévalence de 39,4 %. En outre, une prévalence élevée (36,8 %) a été observée chez les animaux sauvages dans les zoos. Treize séquences d’ADN de Blastocystis sp. ont été déposées dans la base de données GeneBank, révélant la diversité des sous-types présents, dont neuf séquences appartenant au ST1, une au ST3, une au ST4 et deux au ST5, marquant le premier signalement des sous-types ST1, ST4 et ST5 en Algérie. L’étude a également exploré l’association entre Blastocystis sp. et le microbiote intestinal à l’aide d’une approche métagénomique, révélant une prévalence élevée de 37,79 %. Pour la première fois en Algérie, treize sous-types de Blastocystis ont été identifiés, incluant les ST8, ST10, ST14, ST21, ST23 à ST27, ST30 et ST43 à ST45, avec cinq nouvelles séquences découvertes chez des reptiles. L’étude a également identifié cinq nouveaux hôtes, dont la gazelle de Cuvier, la gazelle Rhim, le nilgaut, la sardine et le mulet, et a rapporté pour la première fois la présence de ST21 en milieu aquatique. Enfin, l’influence significative de Blastocystis sur la composition du microbiote intestinal a été démontrée, avec une augmentation de micro-organismes tels que Bacteroides. Plusieurs facteurs, comme la classe taxonomique et le régime alimentaire, ont également été identifiés comme influençant la diversité microbienne en relation avec la présence de Blastocystis sp..